Le coronavirus a muté en trois souches distinctes lors de sa propagation à travers le monde

Les experts suivent «l’arbre généalogique» des coronavirus au fur et à mesure qu’il se propage

Les chercheurs qui ont cartographié une partie de la propagation d’origine du coronavirus chez l’homme ont découvert qu’il existe des variantes du virus dans le monde.

Ils ont reconstruit les premières voies évolutives de Covid-19 alors que l’infection se propageait de Wuhan, en Chine, en Europe et en Amérique du Nord. En analysant les 160 premiers génomes viraux complets à séquencer à partir de patients humains, les scientifiques ont découvert que la variante la plus proche de celle découverte chez les chauves-souris était largement trouvée chez des patients des États-Unis et d’Australie, pas de Wuhan.

Le Dr Peter Forster, généticien et auteur principal de l’Université de Cambridge, a déclaré: «Il y a trop de mutations rapides pour tracer soigneusement un arbre généalogique Covid-19. Nous avons utilisé un algorithme de réseau mathématique pour visualiser simultanément tous les arbres plausibles.

«Ces techniques sont principalement connues pour cartographier les mouvements de populations humaines préhistoriques à travers l’ADN. Nous pensons que c’est l’une des premières fois où ils ont été utilisés pour tracer les voies d’infection d’un coronavirus comme Covid-19. »

Il y a «trop de mutations rapides» pour bien la cartographier, a déclaré le Dr Peter Foster

L’équipe a utilisé des données d’échantillons prélevés à travers le monde entre le 24 décembre 2019 et le 4 mars 2020.

Ils ont trouvé trois variantes distinctes, mais étroitement liées, de Covid-19, qu’ils ont appelées A, B et C.

Pour toutes les dernières nouvelles et mises à jour sur le coronavirus, cliquez ici.

Pour notre blog en direct Coronavirus, cliquez ici.

Les chercheurs ont découvert que le type de coronavirus le plus proche de celui découvert chez les chauves-souris – le type A, le génome d’origine du virus humain – était présent à Wuhan, mais n’était pas le type de virus prédominant de la ville.

Des versions mutées de A ont été observées chez des Américains qui auraient vécu à Wuhan, et un grand nombre de virus de type A ont été découverts chez des patients américains et australiens.

VOIR AUSSI  Le tsunami frappe la Turquie après un séisme de magnitude 7

Le principal type de virus de Wuhan était B et était répandu chez les patients de toute l’Asie de l’Est, mais il n’a pas voyagé bien au-delà de la région sans autres mutations.

L’équipe a utilisé des données d’échantillons prélevés à travers le monde entre le 24 décembre 2019 et le 4 mars 2020 (Photo: Nextstrain)

Les chercheurs disent que la variante C est le principal type européen, trouvé chez les premiers patients de France, d’Italie, de Suède et d’Angleterre.

L’analyse suggère également que l’une des premières introductions du virus en Italie s’est produite par la première infection allemande documentée le 27 janvier et qu’une autre voie d’infection italienne précoce était liée à un «cluster de Singapour».

Il est absent de l’échantillon du continent chinois de l’étude, mais on le voit à Singapour, à Hong Kong et en Corée du Sud.

Les scientifiques affirment que leurs méthodes pourraient être appliquées au tout dernier séquençage du génome du coronavirus pour aider à prédire les futurs points chauds mondiaux de la transmission et de la flambée des maladies.

La souche d’origine s’est déplacée aux États-Unis et en Australie tandis que le type C s’est répandu en Europe (photo: PNAS)

Les résultats sont publiés dans la revue Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

La variante A, la plus étroitement liée au virus présent à la fois chez les chauves-souris et les pangolins, est décrite comme la racine de l’épidémie par les chercheurs.

Le type B est dérivé de A, séparé par deux mutations, puis C est à son tour une «fille» de B, suggère l’étude.

Les méthodes de réseau phylogénétique utilisées par les chercheurs – qui examinent les relations évolutives entre les entités biologiques – ont permis de visualiser simultanément des centaines d’arbres évolutifs dans un graphique simple.

Contactez notre équipe de nouvelles en nous envoyant un e-mail à [email protected]

Pour plus d’histoires comme celle-ci, consultez notre page d’actualités.

Dernières nouvelles et mises à jour sur le coronavirus

Laisser un commentaire

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée.